• 市人民政府办公室
• 市发展和改革委员会
• 市工业和信息化局
• 市教育局
• 市科学技术局
• 市公安局
• 市民政局
• 市司法局
• 市财政局
• 市人力资源和社会保障局
• 市自然资源局
• 市生态环境局
• 市住房和城乡建设局
• 市交通运输局
• 市水务局
• 市农业农村局
• 市商务和投资促进局
• 市文化旅游体育广电局
• 市卫生健康委员会
• 市审计局
• 市城市管理局
• 市统计局
• 市应急管理局
• 市国有资产监督管理委员会
• 市市场监督管理局
• 市住房公积金管理中心
• 市扶贫开发办公室
• 太阳山开发区
• 金积工业园区
• 青铜峡新材料基地
• 市国家农业科技园区
• 吴忠市委办
• 吴忠市编办
• 吴忠市宣传部
• 道路运输管理局
• 吴忠市文化市场综合执法支队
• 市退役军人事务局
• 市金融工作局
• 市信访局
• 市人民防空办公室
• 市医疗保障局
• 市审批服务管理局
• 市粮食和物资储备局
• 市气象局